Archive for September, 2013


21.09.2013

ต้นไม้พันปี

posted by admin

in จิตรกรรมฝาผนัง, ซากดึกดำบรรพ์, บรรพชีวินวิทยา, พันธุศาสตร์, ฟอสซิล, รหัสพันธุกรรม

ใน การศึกษาที่ตีพิมพ์ออนไลน์ที่ 8 พฤษภาคมโดยวารสารธรรมชาติ, Rokas และ Salichos บัณฑิตลีโอนิดานักเรียนวิเคราะห์สาเหตุของการแตกต่างเหล่านี้และนำเสนอชุด ของเทคนิคใหม่ที่สามารถแก้ปัญหาความขัดแย้งและให้ความถูกต้องมากขึ้นในการ ถอดรหัสลึกสาขาของต้นไม้ของชีวิต

“การ ศึกษาโดย Salichos และ Rokas มาในเวลาที่สำคัญเมื่อนักวิทยาศาสตร์กำลังต่อสู้กับวิธีการที่ดีที่สุดในการ ตรวจสอบลายเซ็นของประวัติศาสตร์วิวัฒนาการจากน้ำท่วมจากข้อมูลทางพันธุกรรม. ผู้เขียนเหล่านี้จะให้ข้อมูลเชิงลึกที่น่าสนใจเข้ามาในกล่องเครื่องมือ วิเคราะห์มาตรฐานของเราและบอกว่ามันอาจเป็นเวลาที่ ที่ จะทิ้งบางส่วนของมากที่สุดเครื่องมือของเราที่เชื่อถือได้เมื่อมันมาถึงการ วิเคราะห์ชุดข้อมูลขนาดใหญ่. งานนี้อย่างมีนัยสำคัญอย่างแน่นอนจะท้าทายชุมชนนักชีววิทยาวิวัฒนาการไปคิด ใหม่ว่าดีที่สุดในการสร้างความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการ “ไมเคิลนไวทิงผู้อำนวยการโครงการของระบบและกล่าวว่า วิทยาศาสตร์ความหลากหลายทางชีวภาพที่มูลนิธิวิทยาศาสตร์แห่งชาติซึ่งได้รับ ทุนการศึกษา

เพื่อ ให้ได้รับข้อมูลเชิงลึกในความขัดแย้งนี้ Salichos ประกอบและการวิเคราะห์มากกว่า 1,000 ยีน – ประมาณร้อยละ 20 ของจีโนมยีสต์ทั้ง – จากแต่ละสายพันธุ์ยีสต์ 23 เขา ได้อย่างรวดเร็วตระหนักว่าประวัติศาสตร์ของยีน 1,000 บวกทุกคนแตกต่างกันเล็กน้อยจากกันและกันเช่นเดียวกับการที่แตกต่างจากวงศ์ สร้างขึ้นมาจากการวิเคราะห์พร้อมกันของยีนทั้งหมด

“ฉันรู้สึกประหลาดใจมากโดยผลนี้” Salichos ชี้ให้เห็น

โดย การปรับอัลกอริทึมจากทฤษฎีข้อมูลนักวิจัยพบว่าพวกเขาสามารถใช้วงศ์วานว่าน เครือของยีนเหล่านี้แตกต่างกันที่จะหาจำนวนความขัดแย้งและมุ่งเน้นไปที่ชิ้น ส่วนเหล่านั้นของต้นไม้ที่มีปัญหา

ใน แง่กว้าง Rokas และ Salichos พบว่าข้อมูลทางพันธุกรรมคือความน่าเชื่อถือน้อยในช่วงระยะเวลาของรังสีอย่าง รวดเร็วเมื่อสายพันธุ์ใหม่กำลังก่อตัวขึ้นอย่างรวดเร็ว จุด ในกรณีที่เป็น Cambrian ระเบิด, ปรากฏตัวอย่างปัจจุบันทันด่วน 540 ล้านปีที่ผ่านมาของความหลากหลายที่โดดเด่นของสายพันธุ์สัตว์โดยไม่ทำ ประโยชน์ที่เห็นได้ชัด ก่อนที่ 580 ล้านปีที่ผ่านมามีชีวิตมากที่สุดคือง่ายมากที่ประกอบด้วยเซลล์เดียวจัดเป็น ครั้งคราวเป็นอาณานิคม

“จำนวน มากของการอภิปรายเกี่ยวกับความแตกต่างในต้นไม้ที่ได้รับระหว่างการศึกษาที่ เกี่ยวข้องกับสาขา ‘ป่า’ ที่เกิดขึ้นในเหล่านี้ ‘รังสี’,” Rokas กล่าวว่า

นัก วิจัยยังพบว่ากลับไปในช่วงเวลาที่พวกเขาไปเชื่อถือได้น้อยจะกลายเป็นข้อมูล ทางพันธุกรรม “วิธีการเดทกัมมันตรังสีมีความถูกต้องเพียงช่วงเวลาหนึ่ง” Rokas กล่าวว่า “เรา คิดว่าค่าของข้อมูลดีเอ็นเออาจจะมีข้อ จำกัด ที่คล้ายกันตั้งคำถามอย่างมากในการอัลกอริทึมที่มีอยู่ในการแก้ไขปัญหารังสี ที่เกิดขึ้นในเวลาลึก.”

 

“มัน ได้กลายเป็นเรื่องปกติธรรมดาสำหรับการศึกษาด้านบากแจ้งวงศ์วานว่านเครือที่ รุนแรงขัดแย้งซึ่งกันและกันในการที่สิ่งมีชีวิตบางอย่างผุดขึ้นมาจากเช่น สถานที่ของฟองน้ำบนต้นไม้สัตว์หรือหอยทากบนต้นไม้ของหอย” Antonis Rokas คอร์นีเลียกล่าวว่า เก้าอี้ Vanderbilt ในชีวศาสตร์ที่มหาวิทยาลัย Vanderbilt